《功夫熊貓2》的韓裔導演詹妮弗 于 內爾森在《功夫熊貓》時期的頭銜要更多一些，她既是故事總監、動作場面總監，也是夢境場面總監，換句話說，她是面店小二、熊貓阿寶命運的決策者，當《功夫熊貓》在全球大賣，且“海外市場”遠超北美市場后，她受命統領《功夫熊貓2》。《功夫熊貓2》的編劇喬納森 阿貝爾和格倫 伯杰同樣是第一集的老班底，他們抓住觀眾在看完第一集后的最大疑問“熊貓的爸爸為什么會是一只鴨子？”，在續集中為熊貓阿寶設計了一條“尋找自我”的“心靈之旅”。

　　這個疑問其實有兩個答案，《功夫熊貓2》中的解釋是一個完整的故事。鳳凰城城主的兒子是一只驕傲的白孔雀，人稱沈王爺，年輕時便發明了將煙花轉化為火藥的方法。因為鳳凰城的羊仙姑預言他未來將被黑白相間的對手打敗，沈王爺指揮他的野狼部隊血洗了熊貓村莊，母親帶著幼小的阿寶逃離，最終只能將他隱藏在一個裝滿蘿卜的籃子里。母親吸引了追兵，阿寶隨著蘿卜籃子被一路帶到了鴨子“父親”平先生的面前，被可愛的阿寶打動的平先生決定一輩子守護這只可愛又可憐的熊貓。阿寶后來成為了“神龍大俠”，被父母逐出鳳凰城的沈王爺重回故地，用巨大的火炮征服了鳳凰城后還計劃進軍中原，兩人不可避免地成為了對手。在同陰險強大的沈王爺不斷斗爭的過程中，阿寶逐漸記起了自己的身世，并獲得了內心的平靜。結局當然是邪不壓正，神龍大俠戰勝了對手并得到了“我是誰”這個亙古問題的答案，他回到平先生的面條店，抱住他說：“我是你的兒子，阿寶。”

　　真實的答案則有點無厘頭。《功夫熊貓》的創作初期并非那么指向明確，中華文化也不是早早就劃定好的進軍標靶。《功夫熊貓2》的華人動畫師韓雷“解密”說，最早的出發點其實只是想做個和拳擊有關的動畫片，當策劃部門海闊天空地聊出了一只會拳擊的熊貓后，關于中國功夫的聯想也就順其自然了。“鴨子父親”也是這樣順其自然的結果，最早的設定中，熊貓阿寶根本沒有父母，當編劇想出了關于“父子情深”的橋段后，他們跑去問動畫師手頭上還有什么動物角色，最簡單的邏輯當然是阿寶的爸爸是一只熊貓，但編劇喬納森 阿貝爾和格倫 伯杰卻“希望阿寶是片中唯一的熊貓”，他們最終從兔子、鴨子、鵝和豬中間選擇了鴨子—于是熊貓阿寶就有了一個鴨子爸爸。格倫 伯杰說：“最后我們被迫做出不合理的決定，讓平先生這只鴨子成為阿寶的爸爸，而且這個決定讓整部電影變得更有趣。”