乳品新國標從一開始制定“由誰主導”就存在爭議。后來衛生部提出，生乳標準以農業部意見為主

　　1986年“國標”與國際標準已有明顯差距，2010年標準在其基礎上又大幅降低。爭議焦點集中在“生鮮乳”的蛋白質、菌落總數上。

　　“三聚氰胺事件”成為重新制定乳品新國標導火索。2008年12月，為落實《乳品質量安全監督管理條例》以及《奶業整頓和振興規劃綱要》中乳品安全標準體系，衛生部會同農業部、國家標準委、工信部、中國疾控中心、乳制品工業協會、奶業協會等單位組建了“完善乳品安全標準工作協調小組，負責對乳品安全國家標準進行整合完善。具體起草任務,由衛生部監督局委托衛生部疾病預防控制中心營養與食品安全所承擔。

　　衛生部2010年7月13日發布的“乳品安全國家標準問答”表明，同時也成立了由協調小組各部門推薦的近70名專家組成的專家組，分別來自管理部門、專業技術機構、大專院校、行業協會以及乳品企業。專家組組長由中國疾病預防控制中心營養與食品安全所副所長王竹天擔任。

　　據王竹天及其同事王君,在2010年4月在《中國食品衛生雜志》上撰文“中國首批食品安全國家標準乳品安全國家標準”披露，專家組采取分組討論，分設乳品產品、嬰幼兒配方食品、理化檢測方法、微生物檢測方法及乳品生產規范五個工作組，參與討論人數超過600人。

　　乳品新國標從一開始制定“由誰主導”就存在爭議，其中有不少部門和專家認為，標準制定者應為奶牛養殖歸口單位農業部，而非對乳業并不熟悉的衛生部。后來衛生部提出，生乳標準以農業部意見為主，希望農業部每月單獨例會討論后反饋意見。

　　農業部乳品質量監督檢驗測試中心高級工程師張宗城曾說，與會專家普遍對奶業狀況缺乏了解，迫于時間壓力，最終工作只是對數千項指標的整理合并。

　　王竹天上述文章顯示，專家組在對160余項現行和正在制訂中的乳品相關標準進行分析和討論的基礎上，形成了75項乳品安全國家標準，包括產品標準、生產規范和檢測方法標準三大類，其中產品標準17項，生產規范2項，檢測方法56項。2009年10月衛生部公示并征求各界意見。

　　2010年2月，第一屆食品安全國家標準審評委員會召開各分委員會會議，審查乳品安全國家標準草案，經主任會議審議通過了66項乳品安全國家標準。新乳品安全國家標準于2010年3月26日由衛生部批準公布。

　　對于新國標，爭議點集中在《生乳》標準上。

　　上海奶業協會副秘書長顧佳升表示，衛生部專家組討論此標準所花費的時間在66個標準中是最長的。因為自始至終都有人認為“生乳”不是進入市場流通的產品，不需要建立國家標準，因而在具體內容和指標的討論時反復不斷、歷經曲折。