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美國:全球首臺蛋白質組學高通量質譜儀

中國食品機械設備網 2010-11-23 14:01 包裝機械
來自美國能源部(DOE)西北太平洋國家實驗室(Pacific NorthwestNationalLaboratory,PNNL)的研究人員發

來自美國能源部(DOE)西北太平洋國家實驗室(Pacific NorthwestNationalLaboratory,PNNL)的研究人員發明了一種新型儀器能提高蛋白表達檢測的速度和質量。這種蛋白質譜儀(protein massspectrometer,PROMS)是開發的第一個針對蛋白質組學研究的高通量質譜儀。這一質譜儀由Richard D.Smith和他的同事從一種9.4特斯拉的傅立葉變換離子回旋共振質譜儀(Fourier Transform Ion CyclotronResonance Mass Spectrometer)改裝而來——這種共振質譜儀是由BrukerDaltonics(布魯克·道爾頓公司,著名的儀器公司)制造。
  根據PNNL的報告,PROMS相比于其它MS,靈敏性高100多倍,速度也要快10-100倍。這項新的設計集合了Smith和他的團隊的一項發明:在MS上應用動力學范圍增長(dynamicrange enhancement applied to massspectrometry,DREAMS)。這樣克服了MS同一時間能測量的分子數量限制障礙,利用DREAMS研究人員能排除最大,豐度最高的蛋白的影響,將精力集中在低水平蛋白上。Smith表示,在生物過程中越是數量少,不常見的“player”越是起著重要的作用,就像細胞信號傳導過程中信號因子的作用。
  PNNL研究人員利用這一系統檢測了一巨細胞病毒(cytomegalovirus)——已知引起視網膜炎癥,以及DOE感興趣的3個微生物。在2002年利用PROMS,研究人員識別了耐輻射奇球菌(DeinococcusRadiodurans)中預測蛋白質組的1900多個蛋白(大約共3,200個,占61%)(M.S. Lipton et al.,"Global analysis of the Deinococcus radiodurans proteome by usingaccurate mass tags," Proceedings of the National Academy ofSciences, 99:11049-54, Aug. 20, 2002.),這項成果是當時為止任何生物中覆蓋最廣的蛋白質組分析結果。
  Bruker公司副總裁,生命科學系統總經理JohnWronka認為PROMS技術是哺乳動物蛋白質組學以及“代謝體學”(metabolomics)——一個全新的代謝研究而準備的一門技術,目前PerkinElmer,Bruker等公司都有PROMS儀器,其中PEI的蛋白組學質譜樣品預制工作站特點包括:
  全自動密封系統,杜絕手工操作和環境引入的外來污染,保證樣品回收率和重現性。
  全自動完成樣品脫鹽、濃縮和汛積至MALDl tarqet過程。
  精密的液體處理系統可精確控制樣品的吸附和解吸動力學過程,提高樣品回收率和重現性,并保證質譜檢測的靈敏度。
  一次處理96個樣品。
  靈敏度: 200fmoI BSA。
  可使用Millipore Zip Tip或Amika ProTip。
  兼容所有常用MALDl targets。

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