轉基因食品應當按規定標識，食品安全法的修訂草案中有著相關的規定。草案規定，“轉基因食品未按規定標識”有可能承擔從沒收違法所得、罰款到停產停業、吊銷許可證等各個檔次的處罰，但其中“標簽存在瑕疵但不影響食品安全”的，由縣級以上食藥監管部門責令改正即可，拒不改正的，處二千元以下罰款。

    針對不少人呼吁轉基因食品應當明確標識，草案援引《農業轉基因生物安全管理條例》中已有的農業轉基因生物標識制度，要求“生產經營轉基因食品應當按照規定進行標識”。但具體以什么方式標識、食品標識和農業轉基因生物標識有何區別、如何定義“按規定”等問題，草案均未回答。

    食品的貯存運輸一直被視為食品生產經營的“相關活動”，以涵蓋而不單獨規定的方式存在于法律中。但近年來網購方興，占線上交易相當比例的食品交易面臨的各種問題開始受到重視。6個月前，食品安全法修訂草案首次提交審議時，有些常委會委員即提出，應該對那些并不專業生產經營食品但同樣經手食品貯存運輸的專業倉儲、物流企業進行規范。

    本次修改中增加了如下內容：非食品生產經營者從事食品貯存、運輸和裝卸的，貯存、運輸和裝卸食品的容器、工具和設備應當安全、無害，保持清潔，防止食品污染，并符合保證食品安全所需的溫度等特殊要求，不得將食品與有毒、有害物品一同運輸。