我國的益生菌產(chǎn)業(yè)從上世紀(jì)90年代初開始起步，比發(fā)達(dá)國家晚10年左右，但發(fā)展速度較快。尤其是在大中城市，以雙歧桿菌、乳酸菌為主體的一二代益生菌飲料銷售情況較好。據(jù)統(tǒng)計，僅益生菌類酸奶產(chǎn)品國內(nèi)市場的年銷售額就達(dá)到12—15億元人民幣。但是，這一數(shù)字還是與發(fā)達(dá)國家相距甚遠(yuǎn)，歐美酸奶市場年銷售額已超過10億美元。

　　近幾年來隨著乳酸菌在中國市場的不斷拓展，其發(fā)展也呈現(xiàn)出了一定的問題。

　　首先在資源方面缺乏專業(yè)化的乳酸菌資源庫及可以持續(xù)利用的乳酸菌資源。盡管國內(nèi)各研究單位都各自保藏了一些乳酸菌菌種，但大多分離自國外的發(fā)酵劑或發(fā)酵乳，沒有統(tǒng)一編號，種類單一，且對其遺傳特性不了解，目前還沒有真正意義上的乳酸菌菌種資源庫。

　　其次，我國在益生乳酸菌研究開發(fā)方面基礎(chǔ)研究積累不夠，急功近利和所謂的拿來主義將會嚴(yán)重阻礙我國益生乳酸菌產(chǎn)業(yè)的發(fā)展和企業(yè)的長遠(yuǎn)利益。特別像乳酸菌資源的分離、鑒定、收集、菌種特性的研究是一個長期的戰(zhàn)略性工作，沒有這一基礎(chǔ)性的研究工作很難開發(fā)出優(yōu)良的益生乳酸菌產(chǎn)品。

　　再者研究手段落后，先進(jìn)的分子生物學(xué)技術(shù)在我國益生乳酸菌研究開發(fā)上應(yīng)用的非常少，特別像基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、芯片技術(shù)、生物信息學(xué)等，其結(jié)果是研究的成果沒有足夠的理論深度和說服力，很難造就一個像國外一些企業(yè)所擁有的益生乳酸菌品牌和產(chǎn)品。

　　最后，到目前為止我國尚沒有系統(tǒng)地研究和制定益生菌和益生菌發(fā)酵乳制品標(biāo)準(zhǔn)。因此，出現(xiàn)益生菌名稱叫法五花八門，益生功能夸大宣傳等現(xiàn)象，在益生菌發(fā)酵乳制品方面，對所含益生菌活菌數(shù)以及在貨架期益生菌存活數(shù)也沒有進(jìn)行嚴(yán)格限定，導(dǎo)致益生菌及制品市場異常混亂，甚至出現(xiàn)在益生菌發(fā)酵乳制品中檢驗不出該益生菌的以假亂真現(xiàn)象。