含糖量過高是乳酸菌飲料缺點之一，發酵生產乳酸菌飲料時，除了牛奶本身所含的乳糖外，必需額外加入足量的糖，以確保乳酸菌良好的生長。乳酸菌是指利用碳水化合物（即糖分）發酵產生大量乳酸的微生物（如乳酸桿菌等），也就是說，糖是乳酸菌的“糧食”。

    以味全乳酸菌為例，一般情況下，一小瓶100毫升的味全乳酸菌飲料熱量約為70千卡、含糖量約為16.2克，而每塊方糖只有4.5克，每100毫升可口可樂的含糖量也只有10.6克。
 
    但是時代周報記者調查發現，目前市場上益生菌飲料的主流產品中，只有養樂多、味全等少數幾家是做100毫升產品的，蒙牛、伊利、光明、風行等產品都是340-360毫升裝的大瓶，味全甚至推出435毫升的大瓶，由于產品不宜開蓋后保存，很多消費者都是直接喝完一整瓶，這樣就會無意間攝入大量糖分，甚至超過碳酸飲料。
 
    “另外，現在產品百分之三十的含奶量太少了，也就意味著蛋白含量太少了。”王丁棉表示。