盡管我國的功能飲料發展還不充分，還有著巨大的前景。但是功能飲料的發展也遇到了困局。對于功能飲料的健康性，消費者和專家都存在著質疑。
 
　　拋開營銷推廣之類的掣肘因素不談，實際上，目前大多數功能飲料企業所面對的最大問題就是民眾對于功能飲料產品健康性的質疑。特別是近段時間，外界質疑言論更是甚囂塵上。多家品牌功能飲料不是被曝出維生素B12超標，就是被曝人工咖啡因和糖分過量，潛藏危害。甚至有外國營養專家認為，對于青少年來說，功能飲料幾乎相當于是另一個毒品。
 
　　盡管有些媒體對功能飲料的看法有些言之過甚，但不得不承認，功能飲料如何更為健康地為人體發揮“功效”，的確成為了相關企業必須直面的問題。
 
　　功能飲料的發明，其實可算的上是造福人類的一大福音。在環境逐漸惡化，生活節奏日益加快的狀態之下，對于大多數人來說，不管是生活壓力還是生存壓力，都是越來越大，亞健康人群也在不斷增多。而這時候，能夠迅速補充體能、提神醒腦，甚至是提高人體免疫力的功能飲料，正好充當起了人體蓄電池的作用。也正是如此，功能飲料才贏得了眾多消費者的青睞。
 
　　然而，功能飲料的高速發展卻掩蓋不了整個行業的不成熟。缺乏具體行業標準、市場進入門檻低、行業競爭無序等原因，使得市面上的某些功能飲料產品開始顯露出諸多問題，而在媒體的相繼報道之下，越來越注重健康的消費者對于此類產品已是戒心重重，這也在一定程度上影響了整個功能飲料市場的發展。
 
　　其實縱觀整個市場，很多企業都暴露出了對產品定位不妥的問題，一味強調飲料的“功能性”，而忽視了產品的“健康性”，所以也就導致了很多功能飲料產品為達到所宣稱的“功能”而無所不用其極，致使某些元素超標，反倒對人體產生危害。