污水微波處理法與傳統污水處理法相比較有如下優點：
    1、單位污水處理投資強度低，規模大于5000m?/日時，單位投資強度為800—1000元/噸污水；
    2、占地面積小，同等規模僅為傳統污水處理法的占地面積的1/10—1/30；
    3、工程可大也可小型分散化（堵住污染源頭），污水微波處理技術適于大、中、小型工程的新建或用于對現在正運行中的傳統技術污水處理廠的技術改造（提高產出水質，實現污水資源化），從根本上解決人類的生活和生產活動給江河湖泊帶入的污染使人類步入水環境良性循環；
    4、工藝流程短,污水中污染物降解的物化反應迅速，污水經調配進入微波場20—30秒流出，5—7分鐘完成澄清分離,產出清水和無菌淤泥；
    5、單位污水處理運行費用低,運行費用其中兩項：一是綜合能耗為0.21—0.28度/噸；二是藥劑消耗為0.10—0.20元/噸；
    6、污水中污染物清除徹底，經微波一次性處理后產出的清水其主要理化指標可達到或接近國家地表水環境質量I～II類；
    7、污水處理進程不受周圍環境溫度和原污水污染物濃度影響，傳統污水處理工藝卻受控于這兩個因素的影響；
    8、污水處理過程中可根據需要隨意開、停，傳統生化法和活性淤泥法一旦啟動運行正常不可隨意開、停；
    9、實現水的可持續利用和污水資源化，解決淡水資源日益短缺的問題；（1）產出無菌清水可回用，（2）產出無菌淤泥可作高效復合肥原料；
    10、污水微波處理對殺滅藍藻具有特效，同時殺滅污水中的病原體，示范工程的檢測數據表明：市政污水微波處理前污水入口處大腸桿菌種群數為大于240000個/L，經微波處理后產出清水為小于20個/L。