進口食品不合格的批次和數量整體呈上升趨勢，而“總體穩定，正在向好”是目前我國食品安全的基本面。比如水產品方面，2013年全國水產品監測結果顯示，檢測合格率為94.4%，但較2012年下降了2.5個百分點，是2008年以來的最低值，也是2013年5大類農產品合格率的最低值。

    2013年對蔬菜中甲胺磷、樂果等農藥殘留例行監測結果顯示，檢測合格率為96.6%，自2008年以來，連續6年保持在96.0%以上。畜牧產品方面，自2009年以來，畜產品獸藥殘留抽檢合格率和生豬瘦肉精污染物抽檢持續保持99%以上。
 
    2009年，我國進口食品的不合格批次為1543批次，2010年和2011年分別增長到1753批次和1818批次，2012年的不合格批次達到近年來的峰值，為2499批次，2013年共有2164批次的進口不合格食品因各種原因被拒絕入境。2013年我國進口不合格食品批次最多的前十位來源地分別是中國臺灣（380批次，17.56%）、法國（215批次，9.94%）、美國（175批次，8.09%）、馬來西亞（148批次，6.84%）、德國（125批次，5.78%）、泰國（103批次，4.76%）、意大利（100批次，4.62%）、韓國（97批次，4.48%）、新西蘭（84批次，3.88%）、西班牙（66批次，3.05%）。上述10個國家和地區不合格進口食品合計為1493批次，占全部不合格2164批次的69%。