進入2000年后，沙漠中水產養殖及農業的復合式農場成長快速，多數的農場主利用地下水建立養魚設施，起初將魚養在用來灌溉的儲水槽里，其成果鼓勵了一些業者尋求技術協助，將養殖場整合進農場企業。報告指出高密度養殖的吳郭魚生產量約1030噸。農業部也支持這個潮流，預估在五年間會有數百個這類型的農場開始運作。私營的吳郭魚、鯉魚孵化場已在該區成立，以滿足日益增加的魚苗需求。

    在GAFRD的養殖發展策略里，海水養殖一直被淡水資源有限國家視為是提高漁獲產量的機會。然而該機構也正面臨許多的技術（主要是魚苗產量）及立法的問題，雖然具潛力的銷售收入吸引了私人投資，但卻因高投資成本及隨之而來的風險而卻步。由于海岸區域土地租賃規定的復雜，以及競爭的土地作為旅游優先的情況下，使得立法變得困難。

    有其他組織也以埃及為基地，持續協助水產養殖業擴展，位于Abbassa的世界魚類中心，其養殖及遺傳部主任MalcolmBeveridge博士，是前蘇格蘭Stirling水產養殖協會成員。埃及水產養殖中心訓練及研究應用的合伙有限公司，在IsmailRadwan博士的領導下，除提供培訓課程，也有示范農場，讓游客可以上手培訓。由此可見，埃及水產養殖正蓬勃發展，而非洲其他地區可依循埃及的成功經驗。